怎样得到准确启动子序列(什么是启动子)
一、什么是启动子
启动子(promoter)DNA模板上专一地与RNA聚合酶结合并决定转录从何处起始的部位,也决定基因的转录效率。生物中有许多启动子,如大肠杆菌约有2000个启动子。各启动子的效率可不相同,大肠杆菌的强启动子每2秒钟启动一次转录,而弱启动子每10分钟才启动一次,从百多个大肠杆菌启动子结构的分析,得知两个强启动子的同源序列的中心在转录起始部位(基因编码链上第一个核苷酸) 5'侧约10和35个核苷酸处,弱启动子序列中往往有多处核苷酸被置换。许多原核生物都含有这两个重要的启动子区:
真核生物的启动子部位与原核生物不同,而且启动转录的活性,除需启动子外,还需某些外加序列
二、什么是启动子、终止子、内含子、外显子
以下DNA都用D代替,RNA都用R代替,关键词冠以★
这四个“子”都是存在于DNA分子上的序列,它们的命名,表现了四者在DNA被转录为RNA这一过程中的身份,作为“标记”,标记了DNA将如何被转录成R.
注意,既然有标记,就要有"★RNA聚合酶"来识别这些标记,使指定DNA片段转录成符合需要的RNA.
当生命体需要合成某种蛋白质时,发出指定信号,传达到能识别这种信号的细胞.细胞接到合成任务,将告知RNA合成酶需要转录哪些DNA片段[即基因],R合成酶根据要求,结合到指定的标记上,这个标记叫做——启动子.
★启动子:DNA分子上的转录起始信号序列,是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段序列.
到此,楼主应该可以联想到终止子的意义了,看名字也想到了
★终止子:DNA分子上(基因末端)的转录停止信号序列,具有使RNA聚合酶停止合成R和释放RNA链的作用.
有些终止子的作用可被特异的因子所阻止,使得RNA聚合酶得以越过终止子,继续转录,这称为★通读.
以上是对启动子和终止子的描述.下面是对★外显子和★内含子的描述.
RNA聚合酶结合到启动子上,转录过程开始,R链一直延长到终止子结束.脱离D分子,称为一个叫做原R的分子,原R分子需要被加工[如,去除内含子,保留外显子],才能成为需要的R分子.
这个加工过程在真核生物和原核生物之间有所差别.
原核生物的基因,一般都是★连续的基因,所有的R片段,都将被翻译为蛋白质,即被显式的表达出来,所以就叫外显子.原核生物的D几乎都是外显子.
真核生物的基因,又叫★断裂的基因,因为内含子离散的分布在外显子周围.从原R加工成目的R过程中,内含子将与外显子断开,并除去,因此内含子将不能被翻译为蛋白质,而得到表达.
至此,★外显子就是内被翻译为蛋白质而得以表达的基因片段.而★内含子,则反之.
三、启动子的作用是什么
启动子(promoter)是基因的一个组成部分,在遗传学中是指一段能使基因进行转录的脱氧核糖核酸(DNA)序列。
启动子可以被RNA聚合酶辨认,并开始转录。在核糖核酸(RNA)合成中,启动子可以和决定转录的开始的转录因子产生相互作用,控制基因表达(转录)的起始时间和表达的程度,包含核心启动子区域和调控区域,就像“开关”,决定基因的活动,继而控制细胞开始生产哪一种蛋白质。启动子本身并无编译功能,但它拥有对基因翻译氨基酸的指挥作用,就像一面旗帜,其核心部分是非编码区上游的RNA聚合酶结合位点,指挥聚合酶的合成,这种酶指导RNA的复制合成。因此该段位的启动子发生突变(变异),将对基因的表达有着毁灭性作用。
四、启动子和终止子是什么
启动子和终止子都是一段特殊的DNA序列,属于基因的非编码区,分别位于编码区的上游和下游,负责调控基因的转录。启动子是DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域,在许多情况下,还包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点。终止子是转录过程中能够终止RNA聚合酶转录的DNA序列。使RNA合成终止。
相关资料说明
启动子与起始密码子,终止子与终止密码子看起来似乎差不多。实际上却是两组截然不同的概念,根本就没有共同点。简单地说,启动子和终止子都是一段特殊的DNA序列,属于基因的非编码区。分别位于编码区的上游和下游,负责调控基因的转录。而起始密码子和终止密码子都是mRNA上的三联体碱基序列,分别决定翻译的起始和终止。